W Kownie znajduje się także Ogród Zoologiczny z żywymi zwierzętami. Muzeum zaś przedstawia martwe egzemplarze, ich wypchaną reprodukcję lub obklejone sierścią i skórą manekiny zwierząt. Jest to jedyne w krajach bałtyckich tego typu muzeum, założono je w 1918 roku. Znajduje się ono przy głównym deptaku Kowna na starówce.
Muzeum to ma trzy kondygnacje: parter, pierwsze i drugie piętro. Powierzchnia muzeum, jak i trzy kondygnacje mogą pod pewnym względem przypominać biblijną Arkę, która według obliczeń mogła mieć 133,5 m długości, 22,3 m szerokości i 13,4 m wysokości. Arka była prostopadłościanem. Jej pojemność wynosiła 40 000 metrów sześciennych. Oczywiście Muzeum w Kownie z pewnością nie ma dokładnie takiej powierzchni jak Arka, ale dostarcza pewnych dowodów, że była w stanie pomieścić tak ogromną ilość zwierząt: „ze wszystkich stworzeń wprowadzisz do arki samca i samicę”. Słowo „ wprowadzisz” wskazuje, że do Arki miały wejść tylko zwierzęta lądowe. Z kolei te które żyły w morzach i oceanach stanowią według doniesień blisko 70% żywych istot, których nie było potrzeby wprowadzać. Poza tym na samych zwierzętach lądowych żyje mnóstwo insektów. Budowa Arki najprawdopodobniej trwała 40-50 lat. W tym okresie stała się ona z pewnością mieszkaniem dla wielu gatunków owadów.
Na pierwszej kondygnacji muzeum znajduje się kilkaset największych zwierząt lądowych. Na drugiej kondygnacji znajdują się ogromne ilości ptaków małych i dużych. Na trzeciej kondygnacji m.in. owady plus wiele innych stworzeń.
